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园艺论文_莲萜类合成酶(TPS)基因家族鉴定与分析
 
更新日期:2021-10-22   来源: 电子元件与材料   浏览次数:45   在线投稿
 

核心提示:文章摘要:萜类化合物是植物界中数量最多的天然代谢物,具有多种重要的生物学功能,萜类合成酶(terpenoid synthase, TPS)在萜类

 

文章摘要:萜类化合物是植物界中数量最多的天然代谢物,具有多种重要的生物学功能,萜类合成酶(terpenoid synthase, TPS)在萜类物质合成中起着关键作用。莲(Nelumbo nucifera)是中国重要的药食两用的植物,关于其萜类物质及TPS基因家族的研究相对较少,我们利用生物信息学技术鉴定莲的TPS基因家族,并分析了其基因结构、保守结构域、理化性质、蛋白质结构、基因表达特性等。结果表明,莲的TPS家族共有8个成员,分别命名为NnTPS01~NnTPS08。NnTPSs分为四个亚族,分布在三条染色体上,且均含有1个TPS和1个TPP结构域。理化性质分析表明,莲的TPS家族成员编码的蛋白均为酸性亲水蛋白。二级结构预测显示莲TPS基因家族编码的蛋白均以α-螺旋和不规则卷曲为主。有6个蛋白亚细胞定位于叶绿体。顺式元件分析发现NnTPSs含有多种生物与非生物胁迫的作用元件。基因表达特性分析显示有7个基因可以表达,并且有5个基因在叶中表达量出现了上调,并且发现大多数基因在茎中都不表达。本研究结果为后续研究莲TPS基因家族功能特性提供科学依据。

文章关键词:

项目基金:国家自然科学基金资助项目(31601366),河南省自然科学基金面上项目(202300410114)共同资助, 

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