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畜牧与动物医学论文_中国荷斯坦奶牛GPR120基因SNP位点鉴定及其与产奶性能的关联分析
 
更新日期:2022-02-14   来源: 中国奶牛   浏览次数:27   在线投稿
 

核心提示:文章目录1 材料与方法 1.1 样品采集1.2 基因组DNA提取1.3 引物设计与PCR扩增1.4 序列测定与分析1.5 PCR-RFLP分析1.6 数据统计分

 
文章目录

1 材料与方法

1.1 样品采集

1.2 基因组DNA提取

1.3 引物设计与PCR扩增

1.4 序列测定与分析

1.5 PCR-RFLP分析

1.6 数据统计分析

1.7 连锁分析

1.8 统计分析

2 结果

2.1 中国荷斯坦奶牛GPR120基因PCR扩增结果

2.2 中国荷斯坦奶牛GPR120基因SNP检测

2.3 中国荷斯坦奶牛GPR120基因mRNA二级结构预测

2.4 中国荷斯坦奶牛GPR120基因蛋白二级结构预测

2.5 PCR-RFLP结果分析

2.6 GPR120基因SNP位点的基因型频率和等位基因频率分析

2.7 GPR120基因SNP位点的遗传参数分析

2.8 GPR120基因SNP位点与产奶性状的关联分析

2.9 GPR120基因SNP位点连锁分析

3 讨论

文章摘要:为研究GPR120基因单核苷酸多态性及其与中国荷斯坦奶牛产奶性能的相关性,选取518头中国荷斯坦奶牛为试验对象,提取其总DNA后,PCR扩增GPR120的3个外显子基因片段,筛选目的片段SNP(single nucleotide polymorphism)位点,进而利用在线软件(RNA fold web server及SOPMA)对突变前后GPR120 mRNA和蛋白质的二级结构进行功能分析,最后统计学分析遗传多态性位点与奶牛产奶性能的相关性。结果显示,在中国荷斯坦奶牛的目标群体中,在GPR120基因第一外显子中共鉴定获得9个SNP位点,其中T100G、G413A、C428T、C904T 4个位点为错义突变。通过关联分析发现其中的G413A位点与305 d日产奶量及乳脂率显著相关(P<0.05),与乳蛋白率及体细胞评分呈极显著相关(P<0.01)。T873G位点与305 d日产奶量、乳脂率和乳蛋白率具有极显著相关(P<0.01)。表明GPR120第一外显子处的2个SNP位点G413A和T873G与奶牛产奶性状密切相关,在一定程度上影响牛奶产量、乳脂、乳蛋白含量,其可作为影响奶牛泌乳性能的候选分子辅助选择标记,同时该结果为后续GPR120基因在中国荷斯坦奶牛乳脂合成中的调节机制研究奠定基础。

文章关键词:

项目基金:国家自然科学基金资助项目(31200922,31472249),中国博士后科学基金资助项目(2018M631970),黑龙江省博士后启动基金资助项目(LBH-Z16166), 

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